W skład Urzędu Statystycznego w Krakowie wchodzą następujące komórki organizacyjne:
Wydział Organizacji
Wydział Rejestrów
Wydział Badań Ankietowych
Ośrodek Badania Gospodarki Społecznej
Ośrodek Statystyki Zdrowia i Ochrony Zdrowia
Ośrodek Statystyki Kultury
Ośrodek Statystyki Pomocy Społecznej
Małopolski Ośrodek Badań Regionalnych
w skład Małopolskiego Ośrodka Badań Regionalnych wchodzą:
Dział Udostępniania Informacji
Dział Opracowań Regionalnych
Dział Opracowań Analitycznych
Wydział Informatyki
Wydział Kadr i Szkolenia
Wydział Ekonomiczny
Wydział Administracyjny
Samodzielne stanowisko pracy - radca prawny
Samodzielne stanowisko pracy do spraw ochrony informacji niejawnych
Samodzielne stanowisko pracy do spraw bezpieczeństwa i higieny pracy
Oddział w Chrzanowie
Oddział w Nowym Sączu
Oddział w Tarnowie
Oddział w Zakopanem